Appleが「iPhone 6s Program for Unexpected Shutdown Issues」を開始しています。
これはごく一部のiPhone 6sにおいて予期せずに電源が落ちる不具合があるとのことで、対象となるデバイスは無料でバッテリーを交換してもらうことができます。
対象となるのは2015年9月から10月に製造された端末の一部で、現象があらわれた場合は直営のストアか正規サービスプロバイダ、テクニカルサポートに問い合わせにより確認ができます。
また、この現象について交換プログラム発表前に有償で対応していた場合は、払い戻しにも応じるようです。
参考：iPhone 6s Program for Unexpected Shutdown Issues – Apple Support