Macお宝鑑定団 blogによると、信頼できる情報筋の話として来年2017年にはiPad miniシリーズ後継機もiPad Pro（7.9-inch）となり、3サイズ全てがiPad Proになるとのことです。
7.9インチモデルも他サイズと同様にSmart Connectorと4スピーカー搭載とのこと。記載はありませんでしたが、Proである以上Apple Pencilにも対応とみて間違いないのかなと思います。
12インチモデルは2016年現在最新である9.7インチモデルに搭載されている1,200万画素のiSightカメラやTrue Toneフラッシュ、True Toneディスプレイを搭載。
9.7インチモデルは10.1インチと少し大きくなる（縦約１cm、横約0.5mm）とのこと。また、iPhoneでは7シリーズからイヤホンジャックが廃止されましたがiPad Proには継続して搭載されるそうです。
こうなると、新規モデルは全てiPad Proということになりますね。そもそも無印などベースラインナップがあっての上位機種としてのPro、という気がしなくもないですが、よく見たら今の時点ですでにProとAirとminiというラインナップで無印が無かったですね。
またMacも12インチMacBookが登場する去年までMacBook ProとMacBook Airしか無かったのでApple的には別にこの命名規則で問題なさそうです。
参考：2017年春の次期iPadはiPad Proラインに統一？ | Rumor | Macお宝鑑定団 blog（羅針盤）