いかに最適なルートで仲間を回収し、電車ゴッコの列に加えるか。そして長くなりすぎた列をいかに制するかがパズルアクションゲーム「青春エキスプレス」のキモであり、醍醐味です！気づいたらやり込んでしまう中毒性があります！
リーゼントの髪型がトレードマークの主人公「ミチル君」が故郷に「キラメキ」を取り戻すために電車ゴッコを始めます！
各ステージのクリア条件は画面左上のターン数が0にならないうちに「ミチル君」と指定された仲間たちをゲートに導けばクリアです。進むルートは指でなぞることで決めます。ゲートに導いた仲間は次のステージにも引き継がれ、青春仲間が増えるにつれ1ターンに進める歩数も増えていくので、なるべく多く仲間を集めながら進みましょう！
青春仲間は多いに越したことはないですが、青春仲間が交差してしまうと暴走エキスプレスになり、青春仲間たちがいなくなってしまいます。列が交差しないようにルートを選ばなきゃいけないのが難しい！だが、そこがハマる！
ゲームが進むにつれ、青春仲間の列に気をつけるのはもちろん、ブロックなどの障害物にも気をつけなければなりません。様々な障害物が電車ゴッコを妨害してきます。
そんな時はアイテムを使えば乗りきれます。ブロックが邪魔ならダイナマイトでドッカーンとふっ飛ばせばいいんです！
そんな感じで進めていき、故郷に電車ゴッコで活気を取り戻せるかは「ミチル君（プレイヤー）」次第！？さあ、青春の電車ロープを手に取り、「キラメキ」を取り戻すんだ！